围绕食源性人兽共患病原流行规律、传播特征、遗传演化和防控技术开展系统研究。形成微生物的基因组学与蛋白组学、人兽共患病防控与食品安全、感染与免疫的分子细胞机制、高效新型生物制剂研究、免疫调节生物学研究5个特色鲜明的研究方向。