以微生物为主要研究对象，研究微生物对宿主的识别、侵染和致病等机制。通过研究微生物编码基因在上述过程中的功能，揭示微生物与宿主互作的机制，从而为利用微生物进行基因工程操作，作为生物杀虫剂和生物大分子的表达系统，以及控制微生物导致的疾病提供理论支持。另外，还涉及植物次生代谢产物的提取鉴定及其药用分析，生物大分子与量子点的互作研究。